Автор свыше 500 научных и литературно-критических работ по вопросам славянских литератур и культур, межславянских связей, истории Православия на землях восточных и южных славян. Основные публикации: «Беларуская савецкая літаратура за мяжой» (Минск, 1988 – в соавторстве); «Сербская паэзія” (Минск, 1989); «Антологиjа белоруске поезиjе» (СРЮ: Београд, 1993); «Пошук спрадвечнай існасці» (Минск, 1995) «Сербская Праваслаўная Царква» (Минск, 1998); «Мастацкі пераклад на беларускую мову (Асновы тэорыі і практычныя рэкамендацыі» (Минск, 1997); «Югаславянскія літаратуры і культуры» (Минск, 1999 – в соавторстве); «Югаславянскія казкі” (Минск, 1999); «Косовская битва продолжается» (Минск, 2000); «Лирика источних Словена» (СРЮ: Београд, 2000); «Српска књижевност. Антологија текстова. Књ. 1 – 5»(Минск, 2002-2007) ; «Народ сербскі: яго абрады і звычаі, святы і святыні. 1-2”, (Минск, 2006, 2009, 2012); ”Мовы ўсяго жывога: Сербскія народныя казкі” (Мінск, 2007), “Тэорыя і практыка мастацкага перакладу (Мінск, 2011).
И.А. Чарота – авторитетный популяризатор инославянских писателей. Им опубликовано около 1000 литературно-художественных и богословских переводов, в том числе более 50 отдельными изданиями: произведения святителя Николая Жичского (Велимировича), преподобного Иустина Челийского (Поповича), Патриарха Павла, д-ра Марка С. Марковича, И.Андрича, П.Воранца, Н.Витошевич Чеклич, Б. Зупанчича, М.Лазича, Б.Нушича, Г.Олуич, Д.Чосича, Д.Янчара и др.
Как исследователь и публицист профессор Чарота особое внимание уделяет проблемам исторической общности славян и единства славянских народов в меняющихся геополитических условиях, а при этом сам принимает активное участие непосредственно в процессах духовного возрождения и просвещения в качестве автора монографии «Беларуская мова і Царква» (Минск, 2000) – первой такого рода научной работы; составителя книг «Насустрач Духу. Анталогія беларускай хрысціянскай паэзіі» (Минск, 2001), «Насустрач Духу. Анталогія беларускай хрысціянскай прозы» (Минск, 2002), «Слово и Дух. Антология русской духовной поэзии. Х-ХХ вв.» (Минск, 2003, 2005, 2010), которые отвечают насущным потребностям системы просвещения, не имея аналогов как в Республике Беларусь, так и в странах СНГ; секретаря Библейской комиссии Белорусского Экзархата (Белорусской Библейской комиссии), занимающейся переводом Священного Писания на белорусский язык и разрабатывающей белорусскую церковно-богословскую терминологию; исполнительного редактора журнала «Праваслаўе”, который издается Православным Братством свв. Виленских Мучеников и Свято-Петро-Павловским собором г. Минска; составителя и редактора сборников «Православие в славянских культурных традициях» (Минск, 1996); «Сербская Праваслаўная Царква» (1998), редактора и переводчика русской версии межконфессионального журнала «Самарянин» (Белосток, 1996-2000); редактора книги “Уния. Сборник документов” (Минск, 1997); инициатора и основного исполнителя издательского проекта «Сербское богословие ХХ века» (выпущено уже более 40 книг этой серии, подготовлено еще 3; издатели - Свято-Покровский приход, Свято-Елисаветинский монастырь, «Лучи Софии», издатель Дмитрий Харченко и др.); автора статей для «Православной Энциклопедии» в 25 томах (Московский Церковно-научный центр «Православная Энциклопедия»).
Он один из учредителей и лидеров «Комитета поддержки сербов и черногорцев» (созданного белорусской интеллигенцией во время войны в Боснии и Герцеговине), вице-председатель общества «Беларусь – Югославия», председатель общества «Беларусь – Сербия и Черногория»), общественной организации «Беларусь – сестра Сербии», которая способствовала восстановлению одного из разрушенных храмов в Косово.
Имеет государственную награду Беларуси – премию «За духовное возрождение» (2003 года).
Лауреат Международной премии имени Константина Острожского (Польша) за 1999 год; премии Союза писателей Сербии за 2000 год, премии журнала «Збиља /Reality” (СРЮ, Белград) за 2000 год; премии за лучшую книгу Беларуси в области перевода (2008 г.); награжден памятной медалью Союза словацких писателей (2003 г.) и Золотым знаком Культурно-просветительского общества Республики Сербии ( 2008 г.).
18 мая 2002 года Святейший Патриарх Московский и Всея Руси Алексий II наградил его орденом Преподобного Сергия Радонежского III степени. Решением Синода Сербской Православной Церкви от 21 декабря 2004 года профессор Чарота И.А. награжден орденом Святого Саввы III степени.